李慧慧
职  称
  • 研究员
电  话
  • 010-82106038
电子邮件
  • lihuihui@caas.cn
创新团队
  • 作物生物信息学及应用
研 究 组
  • 作物数量遗传
研究中心
  • 作物基因与分子设计中心
组  员:
研 究 生
  • 李志勇
  • 单丹婷
  • 王轲麟
  • 冯英伟
教育经历
  • 2009年6月获北京师范大学生物数学专业博士学位
  • 2007年9月到2008年11月美国康奈尔大学Buckler实验室访问学者,从事统计基因组学研究
工作经历
  • 2009年7月加入中国农业科学院作物科学研究所,现任作物基因与分子设计中心副主任,研究员,博士生导师
研究方向
  • 利用高通量组学数据开展复杂性状重要基因定位(包括连锁分析和全基因组关联分析)
  • 海量基因型数据连锁图谱构建、全基因组关联分析、全基因组选择育种预测算法开发和模型构建等生物信息学、统计基因组学和数量遗传学相关研究
学术兼职
  • 北京师范大学统计学院兼职教授
  • 农学国际顶级学术期刊《Theoretical and Applied Genetics》编委
  • 《Frontiers in Genetics》编委
  • 《作物学报》编委
荣誉称号
  • 2014年入选研究所优秀青年培育人才计划
  • 中国农业科学院“作物生物信息学”科技创新团队科研骨干
  • 2018年入选中国农科院作科所后备人才
  • 2019年荣获中国农业科学院“科研英才培育工程”院级入选者
  • 2020年入选中国农科院农科英才领军人才B类
  • 2021年荣获中国农学会青年科技奖
获奖成果
  • 在Genetics,TAG,Molecular Ecology,Trends in Plant Science等期刊发表SCI论文46篇,其中第一/通讯作者(含共同)22篇,累计SCI他引3,125次,H-指数24。
承担项目
  • 主持国家优秀青年科学基金项目“数量性状遗传解析方法及育种应用”,2021年1月至2023年12月,直接经费120万元。
  • “十三五”七大作物国家重点研发计划项目子课题“玉米骨干亲本遗传框架图和预测模型构建”(项目批准号2016YFD0100303),2016年7月至2020年12月,经费100万元。
  • 国际集成育种平台项目“A REGIONAL HUB OF THE INTEGRATED BREEDING PLATFORM”,2014年7月至2016年12月,经费26万美元。
  • 国家自然科学基金面上项目“数量性状基因型到表型预测模型的理论及其在植物育种中的应用研究”(项目批准号31471174),2015年1月至2018年12月,经费86万元。
  • “十二五”农村领域国家科技计划子课题“基因发掘和分子育种数据处理分析系统建立”(项目批准号2015BAD02B01-2-2),2015年7月至2019年12月,经费43万元。
  • 作科所“优青培育计划”,2016年1月至2018年12月,经费60万元。
主要论文
  • Jing Li#, Guobo Chen#, Awais Rasheed, Delin Li, Kai Sonder, Cristian Zavala Espinosa, Jiankang Wang, Denise E. Costich, Patrick S. Schnable, Sarah J. Hearne*, Huihui Li*, 2019. Identifying loci with breeding potential across temperate and tropical adaptation via EigenGWAS and EnvGWAS. Molecular Ecology, 28: 3544-3560.下载
  • Fakiha Afzal, Huihui Li*, Alvina Gul, Abid Subhani, Ahmad Ali, Abdul Mujeeb-Kazi, Francis Ogbonnaya, Richard Trethowan, Xianchun Xia, Zhonghu He,and Awais Rasheed*, 2019. Genome-Wide Analyses Reveal Footprints of Divergent Selection and Drought Adaptive Traits in Synthetic-Derived Wheats. G3 , 9: 1957-1973.下载
  • Renyu Zhang#, Gen Xu#, Jiansheng Li, Jianbing Yan, Huihui Li*, Xiaohong Yang*, 2018. Patterns of genomic variation in Chinese maize inbred lines and implications for genetic improvement. Theoretical and Applied Genetics 131:1207-1221.下载
  • Huihui Li#, Awais Rasheed*, Lee T. Hickey, Zhonghu He*, 2018. Fast-forwarding genetic gain. Trends in Plant Science, 23: 184-186.下载
  • Huihui Li, Sukhwinder Singh, Sridhar Bhavani, Ravi P. Singh, Deepmala Sehgal, Bhoja R. Basnet, Prashant Vikram, Juan Burgueno-Ferreira, Julio Huerta-Espino, 2016. Identification of Genomic Associations for Adult Plant Resistance in the Background of Popular South Asian Wheat Cultivar, PBW343. Front. Plant Sci., 7: 1674.下载
  • Huihui Li, P. Vikram, R. P Singh, A. Kilian, J. Carling, J. Song, J. A. Burgueno, S. B., J. Huerta-Espino, T. Payne, D. Sehgal, P. Wenzl and S. Singh, 2015. A high density GBS map of bread wheat and its application for dissecting complex disease resistance traits. BMC Genomics 16:216 DOI 10.1186/s12864-015-1424-5.下载
  • Huihui Li, R. P. Singh, H.-J. Braun, W. H. Pfeiffer, J. Wang, 2013. Comparison of doubled haploids with conventional breeding in CIMMYT wheat breeding programs. Crop Science 53(1): 74-83.下载
  • Ziqi Sun, Huihui Li#, Luyan Zhang, Jiankang Wang, 2012. Estimation of recombination frequency in biparental genetic populations.Genetics Research 94 (3): 163-177.下载
  • Huihui Li, S. Hearne, M. Bänziger, Zhonglai Li, Jiankang Wang, 2010. Statistical properties of QTL linkage mapping in biparental genetic populations. Heredity, 105 (3): 257-267.下载
  • Buckler, S. E., J. B. Holland, M. M. McMullen, S. Kresovich, C. Acharya, P. Bradbury, P. Brown, C. Browne, M. Eller, E. Ersoz, S. Flint-Garcia, A. Garcia, J. Glaubitz, M. Goodman, C. Harjes, K. Hutchins, D. Kroon, S. Larsson, N. Lepak, Huihui Li, S. Mitchell, G. Pressoir, J. Peiffer, M. O. Rosas, T. Rocheford, C. Romay, S. Romero, S. Salvo, H. Sanchez Villeda, Q. Sun, F. Tian, N. Upadyayula, D. Ware, H. Yates, J. Yu, Z. Zhang, 2009. The genetic architecture of maize flowering time. Science 325: 714-718.下载
  • McMullen, M. M., S. Kresovich, H. S. Villeda, P. Bradbury, Huihui. Li, Q. Sun, S. Flint-Garcia, J. Thornsberry, C. Acharya, C. Bottoms, P. Brown, C. Browne, M. Eller, K. Guill, C. Harjes, D. Kroon, N. Lepak, S. E. Mitchell, B. Peterson, G. Pressoir, S. Romero, M. O. Rosas, S. Salvo, H. Yates, M. Hanson, E. Jones, S. Smith, J. C. Glaubitz, M. Goodman, D. Ware, J. B. Holland, E. S. Buckler, 2009. Genetic properties of the maize nested association mapping population. Science 325: 737-740.下载
  • Huihui Li, J.-M. Ribaut, Zhonglai Li, Jiankang Wang, 2008. Inclusive composite interval mapping (ICIM) for digenic epistasis of quantitative traits in biparental populations. Theor. Appl. Genet. 116 (2):243-260.下载
  • Huihui Li, Guoyou Ye, Jiankang Wang, 2007. A modified algorithm for the improvement of composite interval mapping. Genetics 175 (1): 361-374.下载
主要著作
  • 王建康,李慧慧,张鲁燕 (2014)。《基因定位与育种设计》。科学出版社。
授权专利
  • 李慧慧,王建康,染色体片段置换系群体模拟软件V1.0
  • 李慧慧,王建康,全基因组选择预测平台V1.1
  • 王建康,李慧慧,QTL IciMapping 作图软件V1.4
  • 王建康,李慧慧,张鲁燕,孟磊,连锁图谱构建和QTL作图集成软件V3.0
  • 王建康,李慧慧,张鲁燕,孟磊,连锁图谱构建和QTL作图集成软件V4.0
  • 王建康,李慧慧,张鲁燕,孟磊,连锁图构建和QTL作图集成软件V4.1