程溪柳
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创新团队
研 究 组
研究中心
组 员：
研 究 生
- 周悦
- 柳华峰
- 王琦
- 满欣雨
- 张芮
- 姜超腾
- 姜雨佳
- 龚焱佳
- 高美婷
- 石子昂
- 李家灿
教育经历
- 2010-2016，中科院遗传所获遗传学博士学位
- 2009-2013，南京林业大学获林木遗传育种硕士学位
- 2003-2007，南京林业大学或生物技术学士学位
工作经历
- 2022.01至今中国农业科学院作物科学研究所 副研究员
- 2018.09-2021.12 中国农业科学院作物科学研究所 助理研究员
- 2016.06-2018.08中国农科院生物技术所 博士后
研究方向
- 作物基因功能及生化分子机制研究
- 1、 作物抗逆抗病和高产协同基因克隆功能解析和分子育种
从事水稻优异基因挖掘和分子育种研究，水稻和小麦抗逆稳产高产基因、谷子抗病优异基因挖掘机制解析和应用研究。
从水稻528个EAR类型的转录因子筛选出57个盐诱导基因，通过大田耐盐性表型IDS1开展耐盐机制研究（第一作者，Plant Physiology, 2018，见论文3），发现其通过表招募表观遗传修饰组分发挥功能，国际同行在Plant Physiology发表同期评论对该工作做出高度评价；进一步鉴定IDS1的耐盐网络新组分，明确miR172a、miR172b对IDS1转录后水平特异性调控，增强水稻、小麦和谷子耐盐性（第一作者，New Phytologist，2021；通讯作者，Journal of Integrative Agriculture，2023）；筛选出10个IDS1互作蛋白IIP，通过表型筛选鉴定出多个协同调控水稻耐盐性和产量的新基因。
近期开展水稻、小麦耐盐基因挖掘，从资源群体、野生稻和航天育种诱变材料中挖掘优异抗逆基因；对耐盐相关代谢和分子合成通路开展研究。发现小麦开花时间调控新网络miR156-TCP-FBH/PFT1（共同第一作者，Plos Genetics, 2017）、解析小麦分蘖调控因子网络研究miR156-SPL-TB1/BS1（共同第一作者，Plant Physiology, 2017）。精细定位并克隆谷子成株期谷瘟病广谱抗病基因BRG1，将其导入主栽品种中谷2进行抗病性改良。鉴定谷子调控穗发育的关键基因SiTAA1，研究其协调产量及抗逆的分子机制。相关工作连续获得2019-2022、2023-2026国家自然基金青年和面上项目资助。
- 2、农业分子新技术体系开发
开发作物基因组高通量提取方法和设备整套系统。开发作物基因型检测新技术——“连接子ligseq”和“TEAseq”测序、液相芯片等技术。包括半自动核酸提取纯化仪（ZL202021400342.X）、钢珠分装器（ZL202121660745.2）、底部侧吸式磁力架（ZL202021917582.7）。连接子技术高覆盖度、高信/噪比、低成本，结合Illumina二代测序平台获得全基因组上位点可控、数量可控的变异标记，可广泛用于作物核心位点检测、标记加密、突变体插入位点检测等，实现快速聚合育种和作物突变库构建（通讯作者，Journal of Genetics and Genomics，2021）。转化开发收入300万元。相关工作2019-2023年连续获得院级项目平台技术创新任务、2022-2025国家“生物育种专项”资助。
荣誉称号
承担项目
- 国家生物育种专项科技创新2030-重大项目，高通量基因型鉴定、分析与检测支撑体系建设，2022ZD0401701，273.7万，2022.12-2025.12，子课题负责人，第1
- 国家自然科学基金面上项目：谷子成株期谷瘟病广谱抗性基因BRG1的图位克隆、功能研究与机制解析，32272086，63万，2023.01-2026.12，主持人，第1
- 国家自然基金青年基金，SiTAA1调控谷子穗发育的功能研究和机理分析，国家基金委，31901595，25万，2020.01-2022.12，主持人，第1
- 国家重点研发计划，杂粮作物核心资源遗传本底评价和深度解析 科技部，2019YFD1000703 595/252万 2019.05-2022.12 任务负责人，第1
- 国家重点研发计划，杂粮作物抗逆和品质形成与调控 科技部，2018YFD1000702 610/180万 2018.07-2022.12 科研骨干，第2
- 博士后科学基金，第61批面上项目 中国博士后科学基金2017M611064 5万 2017.05-2018.06 主持人，第1
主要论文
- Xinyu Man, Sha Tang, Yanqing Chen, Xianmin Diao, Xiliu Cheng.Journal of Integrative Agriculture, 2024,JIA-2023-2614.R1 通讯作者下载
- Xiliu Cheng1* , Qiang He1* , Sha Tang1* , Haoran Wang2,3, Xiangxiang Zhang4,5, Mingjie Lv1 , Huafeng Liu1, Qian Gao1, Yue Zhou1, Qi Wang1, Xinyu Man1, Jun Liu1 , Rongfeng Huang5 , Huan Wang5,6 , Tao Chen4,5 and Jie Liu2,3. The miR172/IDS1 signaling module confers salt tolerance through maintaining ROS homeostasis in cereal crops.New Phytologist (2021) 230: 1017–1033 第一作者下载
- Mingjie Lyu a, 1, Huafeng Liu b, 1, Joram Kiriga Waititu c, 1, Ying Sun c, Huan Wang c,Junjie Fu a, Yanhui Chen b, Jun Liu a, *, Lixia Ku b,*, Xiliu Cheng a, *TEAseq-based identification of 35,696 Dissociation insertional
mutations facilitates functional genomic studies in maize，2021，Journal of Genetics and Genomics，48 (2021) 961e971 通讯作者下载
- 程溪柳, 王琦, 智慧, 满欣雨, 刘君, 刁现民*.谷瘟菌生理小种致病力鉴定及遗传转化体系建立.中国科学: 生命科学, 2023, 53下载
- 周 悦1，2，程溪柳2，高 英2，孙莹璐2，王 欢3，刘 君2，白江平1.高通量半自动基因组DNA 提取仪的开发与应用，植物遗传资源学报,2022，23（4）：1224-1232
Journal of Plant Genetic Resources 第二作者下载
- Cheng xiliu et al.INDETERMINATE SPIKELET1 Recruits Histone Deacetylase and a Transcriptional Repression Complex to Regulate Rice Salt Tolerance. Plant Physiology, 2018, 2: 824–837 ，IF 6.305. 第一作者下载
- Liu Jie*, Cheng Xiliu*, et al. miR156-Targeted SBP-Box Transcription Factors Interact with DWARF53 to Regulate TEOSINTE BRANCHED1 and BARREN STALK1 Expression in Bread Wheat. Plant Physiology, 2017，3, 1931–1948,，IF 5.949 共同一作下载
- Liu Jie*, Cheng Xiliu*，et al. MicroRNA319-regulated TCPs interact with FBHs and PFT1 to activate CO transcription and control flowering time in Arabidopsis. PLoS Genetics, 2017, 5, e1006833，IF 5.4 共同一作下载
- Liu Jie, Cheng Xiliu, et al. The miR9863 Family Regulates Distinct Mla Alleles in Barley to Attenuate NLR Receptor-Triggered Disease Resistance and Cell-Death Signaling, 2014, Plos Genetics 共同一作下载
- Jiang Cong，Cheng Xiliu et al, HIGH-EFFICIENCY TRANSFORMATION OF THE PLANT PATHOGENIC FUNGUS
MARSSONINA BRUNNEA,Journal of Plant Pathology
,2014,96(3), 11-16 共同一作下载
授权专利
- 一种便携式96孔超顺纳米磁珠操作仪(ZL202021400342.X)，实用新型专利，授权,第3名；
- 一种上吸式钢珠分装器(ZL202121660745.2)，实用新型专利，授权,第2名；
- 一种底部侧吸式磁力架(ZL202021917582.7)，实用新型专利，授权,第2名；
- 与大麦抗白粉病相关的miR167d及其应用（CN201510586893.7），2018年02月获国家发明专利，公开号CN105177001B，第4名
- SiLCYE调控玉米黄质等谷子类胡萝卜素合成代谢的功能及应用(202111177100.8)，国家发明专利,授权,第6名
